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能源工業的微生物檢測分離和測量微生物有一個更好的方法。在冷卻塔中,追蹤細菌不僅僅是微生物的生長——你要追蹤風險和測量效率。這些都是能源工業的基本任務,但它們本質上也是無休止的。這是個機會。一種更快、更低成本地分離和測量微生物的方法,將使月復一月的回報成倍增長。你會節省時間,節省金錢,提高成績。無限期的。快速微生物檢測。RAN 生物技術公司的利工藝簡單,成本低廉,而且可以在數小時而不是數天內得到可靠的數值結果。我們的兩步手持測試正在改變能源工業追蹤微生物的方式。你只需要花一點時間自己測試一下。此外,如果需要,可以擴大檢測范圍,以確定檢測到的微生物。
用于單細胞圖解研究的人腸組織的解離和 inDrops 微流體封裝 Alan J Simmons 1,Ken S Lau 2 Affiliations expandPMID: 35880121 PMCID: PMC9307676 DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101570 Free PMC article leAbstractIn 基于液滴的單細胞 RNA 測序(scRNA-seq)實驗,將細胞連同其周圍的一些緩沖液和環境材料封裝成液滴用于 mRNA 捕獲和條形碼。該方案詳細說明了使用冷活性蛋白酶進行人體腸道組織解離的步驟,以及隨后分離單個上皮細胞,通過洗滌富集活力。接下來,描述了在 inDrops scRNA-seq 平臺上封裝的步驟。該方法已被證明適用于息肉、癌癥和發炎組織。關于該方案的使用和執行的完整細節,請參閱 Chen 等人(2021)。關鍵詞: RNAseq; 單細胞。2022作者。利益沖突聲明作者聲明沒有相互競爭的利益。
環境研究用于環境研究的微生物分離和檢測知道水中有什么變得越來越容易。從海洋研究到生物醫學再到野生動物研究,環境研究人員必須盡可能多地了解他們所研究的世界,才能產生新的發現。微生物的分離和檢測是一個不可少的環節。但是傳統的培養皿方法需要幾天才能得到結果。 RMD 做得更快,更經濟,并且具有同樣或更多的準確性??焖傥⑸餀z測的核心創新是一種智能親和色譜法納米材料,可以捕捉和分離樣本中的微生物。結果是可視的和數字化的,但測試可以用小型設備在現場進行。結果需要幾個小時,甚至幾分鐘。這種轉變正在改變研究的方式,你只需要花一點時間親自嘗試一下。
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全球流行的絕大多數病原體未被發現,影響了病人的護理,阻礙了疫情的準備和反應。為了能夠進行常規監測和全面的診斷應用,需要能夠擴大測試許多樣品的檢測技術1,2,3,同時測試許多病原體4,5,6。在這里,我們開發的組合陣列反應多重評價核酸(CARMEN) ,一個可擴展的平臺,多重病原體檢測。在 CARMEN 平臺中,含有基于 CRISPR 的核酸檢測試劑7的納升液滴在微孔陣列中自組織8與擴增的樣品液滴配對,重復測試每個樣品針對每個 CRISPR RNA (crRNA)。CARMEN 和 Cas13檢測(CARMEN-Cas13)的組合能夠在單個陣列上對超過4,500個 crRNA 靶對進行強有力的檢測。使用 CARMEN-Cas13,我們開發了一種多重測定法,可以同時區分至少10個已發表基因組序列的所有169種人類相關病毒,并快速加入另外的 crRNA 以檢測2020年2019冠狀病毒疾病大流行的病原體。CARMEN-Cas13進一步實現了甲型流感病毒株的全面分型和幾十種 HIV 耐藥突變的多重鑒定。CARMEN 的內在復用和吞吐能力使其具有可擴展性,因為小型化使每次測試的試劑成本降低了300多倍??蓴U展的,高度復用的基于 CRISPR 的核酸檢測將診斷和監測工作從高優先級樣品的有針對性測試轉移到大樣本集的綜合測試,極大地有利于患者和公共衛生9,10,11。
主要傳染病是對人類健康和安全的一些最大威脅,然而,對于絕大多數致病微生物,目前還沒有廣泛可用的分子檢測方法,這限制了它們的診斷和監測。在許多能夠感染人類的病毒物種中(其中576個已經測序,其中169個在2018年10月之前至少有10個已發表的基因組12) ,只有39個具有經 FDA (美國食品和藥物管理局)批準的診斷。雖然已經開發了實驗室開發的測試,用于在特定設施對不同的病原體進行臨床測試,但這些測試可能周轉時間很長,而且很少復用。常規的綜合診斷檢測將提供以前無法獲得的數據流,通知患者、醫護人員和政策制定者抑制和減輕疾病暴發。然而,由于缺乏可擴展和多路復用的技術來快速廉價地鑒定任何循環病原體,這些工具并不普遍可用(圖1a)。通過測序或微陣列雜交進行全面的疾病檢測提供了關于病原體基因型和進化的詳細信息,但由于樣品制備的成本和后勤需求,難以大規模實施4,5,6,13??焖?,低成本的檢測方法,如基于 CRISPR 的方法,基于抗原的檢測,PCR 或環介導的等溫擴增(LAMP) ,在給定的反應中僅檢測一種或少量的病原體1,2,3,7,14,15,16。結合這些方法的優點,一個理想的診斷和監測技術將是高度多元化和容易規模跨數百個樣本。
在人類和動物群體中鑒定多種循環病原體是一個大規模的檢測問題。CARMEN-Cas13工作流程示意圖。C,寨卡 cDNA 通過具有原子摩爾敏感性的單一 CARMEN-Cas13測定和數十個重復液滴對(黑點,重復數量為藍色)檢測; 紅線顯示中位數并用于構建下面的熱圖。頂部,有代表性的水滴圖像。AU 任意單位。
微型化和自組織微流體技術使生物化學和細胞分析的大規模復用成為可能[17,18,19,20,21]。我們最近開發了一個微孔陣列系統,利用微型化和自我組織進行全面的組合實驗。在這個系統中,用戶準備一組輸入作為液滴乳劑,輸入液滴在陣列的井中組織自己,創建所有可能的成對組合,而不需要額外的用戶努力或主動儀器8。我們設想基于 CRISPR 的核酸檢測可以與微孔陣列系統相結合,并行測試多個擴增樣品的多個分析物。
為了實現高度復用的核酸檢測,我們開發了 CARMEN (圖1b,擴展數據圖1)。CARMEN-Cas13的輸入是通過 PCR 或重組酶聚合酶擴增(RPA)和 Cas13檢測混合物擴增的樣品,其含有 Cas13,序列特異性 CRISPR RNA (crRNA)和切割報告基因7(擴展數據圖1)。每個放大樣品或檢測混合物在傳統的微量滴定板中制備,并與作為光學標識符的特的基于溶液的熒光色碼結合。每種顏色編碼的溶液在含氟油中乳化,得到1-nl 的液滴。一旦乳化,來自所有樣品和檢測混合物的液滴匯集到一個單管中,并且ーー在一個移液步驟中ーー裝載到由聚二甲基硅氧烷(PDMS)模制的微孔陣列芯片中(圖1b,擴展數據圖1,2)。陣列中的每個微孔隨機容納來自池的兩個液滴,從而自發形成液滴化輸入的所有成對組合,并且陣列密封在玻璃基板上以物理隔離每個微孔。通過使用熒光顯微鏡鑒別液滴的顏色代碼來確定每個微孔的含量。暴露在電場中會合并每個微孔中的液滴對,并同時啟動所有的檢測反應。熒光顯微鏡用于監測每個檢測反應(圖1b,擴展數據圖1,2)。
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